工伤认定程序是否以确认劳动关系的仲裁条款程序为前提，即工伤认定部门在工伤认定过程中是否有权确认劳动关系，在律师实务中存在较大的争议。

 在工伤认定中，职工与用人单位发生劳动关系争议，劳动保障行政部门能否直接作出工伤认定，应根据不同情况，作出不同的处理。

 如果工伤认定中是对劳动关系的事实存在争议，即因对事实真与假的看法不同而引发的争议，劳动保障行政部门可以根据有关规定和案件事实作出判断，从而做出认定工伤的决定。

 如果是在适用法律方面存在争议，即对事实证据的真伪不存在争议，但对相同的事实证据，由于法律规定不明确导致当事人之间产生不同的观点，需要正确适用法律才能作出判断的争议，则由劳动仲裁部门予以确认，然后根据仲裁部门对劳动关系的裁决作出是否认定工伤的决定。

 区分劳动关系的事实和法律适用主要是基于以下理由：

 一、《工伤保险条例》已赋予工伤认定机关查明事实的职权。

 二、完全否认工伤认定机关的确认权，对需要及时获得补偿的工伤职工来说显然是十分不利的。

 三、工伤认定机关的主要任务是调查核实工伤事故或职业病。完全赋予工伤认定机关确认劳动关系的权利，可能抹杀工伤认定本身的特点和性质。

 四、可能导致工伤认定部门与仲裁部门的不同结论。