超过了两年的申请执行期间，法院依然会受理立案，根据民诉法解释481条：“申请执行人超过申请执行时效期间向人民法院申请强制执行的，法院应予受理。”

如果被执行人林某认为申请执行人张某已经超过申请执行时效，可向法院提出异议。林某未对申请执行时效提出异议的，法院不应对申请执行时效问题进行释明或直接适用时效的规定终结执行。就是说林某只是说没钱需要缓缓等，却没提出时效已经经过的异议，法院就当作没看见不不能主动释明也不能直接终结执行。

林某对申请执行时效期间提出异议，法院经审查，申请执行人张某不能提供在两年期间内提出要求林某履行的相关证据，就是不存在申请执行时效的中止、中断情形，法院会裁定不予执行。不过被执行人林某在申请执行时效期间届满后，履行了全部或者部分义务后，发现执行时效期间届满，以此为由请求执行回转的就是要求返还款项的，法院不予支持。”

 案件进入执行程序后：

首先，及时主张权利申请执行。权利人应当及时向义务人主张权利，要求对方履行法律文书确定的义务。如对方拒绝履行的，可及时向法院申请强制执行。

其次，提出履行要求应保留证据。“提出履行要求的情形会导致申请执行时效的中止、中断。保留相关书面沟通的文书、邮寄材料的单据、短信或微信的沟通记录电话录音等证据。

最后，因为法院不主动对申请执行时效问题进行释明。被执行人认为申请执行人的申请已经超过申请执行时效的，可通过执行异议程序提出异议，由法院进行审查认定。