随着商业秘密保护的加强，竞业限制制度随之产生。竞业限制致使保护商业秘密的一种方式，商业秘密保护并不等同于竞业限制。具体区别在于;
1、侵犯商业秘密的后果是法定的，违反竞业限制义务的违约金则是约定的。竞业限制是契约行为，用人单位与劳动者之间秉持双方自愿的原则签订竞业限制合同，违反该约定则承担违约责任。侵犯商业秘密承担的是侵权责任，即停止侵权、消除危险、赔偿损失等。
2、用人单位与劳动者签订竞业限制协议后，由于该约定对劳动者的劳动权、择业自由等有一定限制，因此，用人单位需对劳动者进行必要的经济补偿，但劳动者一旦知晓了用人单位的商业秘密，则必须依照法律规定保守秘密，用人单位无须向保守商业秘密的劳动者支付经济补偿金。
