(一)、仲裁实效的起算和实体审查期限

如果劳动者向用人单位追索劳动报酬，法院是否应当会对全部期限内的劳动报酬事项均做实体审查。对此，在实践中也存有两种观点。

第一种观点认为，加班工资争议完全适用追索劳动报酬的特殊时效。

第二种观点认为，劳动者可以主张两年以内的加班工资，超过两年的部分劳动者已无实体权利。

(二)、举证责任的分配

1、劳动争议调解仲裁法第6条：发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供;用人单位不提供的，应当承担不利后果。

2、劳动争议司法解释三第9条：劳动者主张加班费的，应当就加班事实的存在承担举证责任。但劳动者有证据证明用人单位掌握加班事实存在的证据，用人单位不提供的，由用人单位承担不利后果。