现代各国“一方面承认约款为大量交易所需要，但又想否定其不合理条款的效力。然而，政策上的干预如何正当化是理论上的难题”。格式合同在具有诸多益处的同时，其也有消极的一面特别是法律风险是不能回避的。
格式合同有违公平原则之虞的风险，格式合同制订者过于强调保护自身利益而忽略了相对人的利益保护，违反公平原则从而影响合同效力的风险。
根据《合同法》第三十九条规定：“采用格式条款订立合同的，提供格式条款的一方应当遵循公平原则确定当事人之间的权利和义务”此款即体现了格式合同应当遵循公平原则，在格式合同中，格式合同制订者应当公平合理地确定合同相对人与其之间的权利，不得利用自身有利地位，将意志强加于相对人，损害相对人的利益。
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