由于许可分为具有物权效力的专有许可和仅有债权效力的普通许可，因此在与转让作比较时应注意区分。

(1)性质上的差异(借用与不动产(土地)之利用的比照来说明)

1)许可相当于土地的租赁(普通许可)或者地上权的设定(专有许可)，许可期限届满后，权利又重新回到著作权人那里。与土地的利用唯一的不同在于无体物的利用不同于有体物，在(普通)许可他人使用的同时，并不妨碍著作权人自己使用或者再许可他人使用。

2)转让则相当于土地所有权的转让，权利永久地转移到受让人那里。

(2)效力上的差异

1)许可 因许可类型不同，效力也有所不同。普通许可仅具有债权性的效力，不能对第三人主张。而专有许可则具有物权性效力，可以对第三人主张。

2)转让 转让后，受让人取得部分或者全部的著作权，当然可以对任何人主张。

(3)认定

现实中，由于著作权人一方或者合同双方的法律知识的缺乏，难以辨别其利用合同是著作权的转让还是许可。这时，只能依照法律行为解释的一般方法去解释当事人的意思。

简而言之，专利权转让与专利权许可定义完全不同。专利权转让是专利权人将该专利所有的专利权转让于给他人，专利许可是指专利权人仍然拥有专利权，以另一种形式许可予其他人实施使用权。专利许可时专利所有权依旧归自己，而专利转让则是指改变了专利的所有权。