由于我国《劳动合同法》和《劳动法》中均没有对因不可抗力造成上班迟到的情况进行规定，我们只能参考其他相关法律的规定。我国《合同法》第一百一十七条规定：“因不可抗力不能履行合同的，根据不可抗力的影响，部分或者全部免除责任，但法律另有规定的除外。当事人迟延履行后发生不可抗力的，不能免除责任。本法所称不可抗力，是指不能预见、不能避免并不能克服的客观情况。”由于《劳动合同法》也应该满足《合同法》的相关规定。则有以下情形

1. 若当事人是善意的

因此根据《合同法》，我们可以认为，不能按时上班属于不能履行劳动合同，而洪水属于自然灾害，即不可抗力，只要洪水在假期之内发生，从而影响甲无法正常上班，甲就可以主张无责，单位也不能借此扣除甲的工资。

2.若当事人是恶意的且没有通知对方且在合理时间内提供证明的

根据我国《合同法》第一百一十八条规定：“当事人一方因不可抗力不能履行合同的，应当及时通知对方，以减轻可能给对方造成的损失，并应当在合理期限内提供证明。”如果甲因为洪水的原因，故意拖延上班时间，并不向单位作出必要说明，那么根据上述法条，甲不能主张无责，单位可以要求甲承担相应损失，可以采取扣除甲工资的方法。