配偶下落不明的离婚程序分为两种，即配偶下落不明满两年或两年以上，当事人可提出离婚和配偶下落不明满两年或两年以上，当事人可以依法向人民法院申请下落不明人失踪。
配偶下落不明，可以提出离婚诉讼配偶下落不明的离婚诉讼分“下落不明不足两年”和“下落不明满两年或两年以上”两种。
配偶下落不明不足两年，是因配偶出走，不与家庭联系，不承担家庭义务，故意违反婚姻义务而导致婚姻情感确已破裂离婚的主要原因。当事人可依据《婚姻法》第三十二条第五项“其他导致婚姻关系破裂的原因”向被告最后居住地的人民法院提起离婚诉讼。
配偶下落不明满两年或两年以上的，当事人有两种方法达到解除婚姻关系的目的：
一、配偶下落不明满两年或两年以上，当事人可提出离婚。
由于被告下落不明，当事人可在被告最后居住地的人民法院提出离婚诉讼，人民法院依最高人民法院关于适用《中华人民共和国民事诉讼法若干问题的意见》第151条的规定“对下落不明人用公告送达诉讼文书”，下落不明人在公告规定的期限未到人民法院出庭的，人民法院可依法缺席判决。
二、配偶下落不明满两年或两年以上，当事人可以依法向人民法院申请下落不明人失踪(下落不明满两年)或死亡(下落不明满四年后以上)，人民法院依法宣告下落不明人失踪或死亡，其婚姻关系也在宣告之日起解除，申请人可持人民法院的公告在婚姻登记机关办理再次结婚手续。
协议离婚的程序
《婚姻登记条例》
第十条 内地居民自愿离婚的，男女双方应当共同到一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关办理离婚登记。
中国公民同外国人在中国内地自愿离婚的，内地居民同香港居民、澳门居民、台湾居民、华侨在中国内地自愿离婚的，男女双方应当共同到内地居民常住户口所在地的婚姻登记机关办理离婚登记。
第十一条 办理离婚登记的内地居民应当出具下列证件和证明材料：
(一)本人的户口簿、身份证;
(二)本人的结婚证;
(三)双方当事人共同签署的离婚协议书。
办理离婚登记的香港居民、澳门居民、台湾居民、华侨、外国人除应当出具前款第(二)项、第(三)项规定的证件、证明材料外，香港居民、澳门居民、台湾居民还应当出具本人的有效通行证、身份证，华侨、外国人还应当出具本人的有效护照或者其他有效国际旅行证件。
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