行为人偷配单位保险柜钥匙后私自秘密取走柜内现金，采用留言的方式表明身份，并称会连本带利归还该现金的行为不符合民间借贷行为的实质特征，已经构成犯罪，具体理由如下：

民间借贷属于借款合同，根据最高院1999年2月13日发布的《关于如何确认公民与企业之间借贷行为效力问题的批复》规定，公民与企业之间的借贷属于民间借贷，必须双方当事人意思表示真实方可认定有效。

评价一行为是否构成犯罪，需要考察该行为是否在客观上已使我国《刑法》所保护的法益遭受到实际的侵害。《刑法》关于侵犯财产类犯罪的规定，主旨是保护公私财物的合法所有权及其他合法占有状态。

主观目的上：行为人秘密取得现金后将赃款带离公司时，即已完全排除了权利人对该笔资金的支配，实现了非法占有的目的。即使在事后，其将赃款返还给被害人，也只能为事后的一种悔罪表现，不影响对其行为时非法占有目的的认定。

作案手段上：行为人私自偷配钥匙一把，趁公司午休无人注意之机，进入财务室，打开壁橱，取走现金后又将壁橱锁好的系列行为，均是在该资金的所有人公司及其老板、保管人未察觉的情况下所为，故其行为符合盗窃罪中“秘密”窃取的行为特征。其事后留下字条表明作案人身份并声称会连本带利归还的行为，只是使被害人“事后”知情，不影响其作案时“秘密”窃取事实的成立。