第一，房屋所有权证上记载了用途，且实际用途与记载用途一致。此类情形基本没有争议，房屋征收部门如实按照房屋所有权证上记载的用途认定、登记即可。
第二，房屋所有权证上记载了用途，但实际用途与记载用途不一致。此类情形基本上以“住改非”为主。“住改非”房屋虽然登记为住宅，但是由于其位置较好，适用于商业或者其他非住宅用途，造成其实际价值远高于相邻的住宅。对于这类房屋，房屋征收部门将登记用途和实际用途均进行登记为妥，对于具体实际用途应当按照房屋用途的法定标准确定。在登记实际用途时，被征收人应当提供相关的实际用途的凭证，比如营业执照、税务登记证、纳税凭证等。
第三，未进行房屋所有权登记，手续不全的。此类情形的房屋比较复杂，虽然这些房屋没有进行房屋所有权登记，但是并不是没有房屋建设的手续，比如可能有国有土地使用权证、国有土地使用权批准文件、建设用地规划许可证、建设工程规划许可证等。这些资料证明房屋在建设过程中取得了一定的手续，相对于任何手续都没有的房屋，其违法性要轻一些。还有一些是历史原因造成的，如因住房制度改革遗留下来的集资房、合作房等。对于此类情形的房屋，应当尽可能结合相关资料认定其房屋用途。
在上述案例中，被征收房屋虽曾经用于经营性用途，某甲也提供了相应的营业执照佐证，但营业执照显示该房屋上的A公司已在2008年12月停止营业，该房屋在征收时并未用于经营性用途。同时，该房屋的登记用途也是居住用房。因此，在某甲没有提供其他充分证据证明该房屋为经营性用房的情况下，将其认定为居住用房，并以此为准进行征收补偿并无问题。
