为什么人民法院判决违法征收案件的赔偿，必须高于同等情形的协议？法律解答：征收的最终目的是通过公平补偿，保护被征收群众的利益，使房屋被征收的群众居住条件有改善、原有生活水平不降低，才能统筹兼顾工业化、城镇化建设和房屋被征收群众的利益，努力把公共利益同被征收人个人利益统一起来。征收补偿协议是约定征收当事人之间权利与义务关系的合同。为了更好地推进征收补偿依法、有序、平稳进行，征收条例鼓励和引导征收人和被征收人以签订补偿安置协议的方式解决补偿问题，以减少纠纷。
但在达不成补偿协议的情况下，行政机关违法征收，因房屋征收引发的行政赔偿有别于一般意义上的侵害财产权引发的行政赔偿，行政机关所承担之赔偿责任不应低于其因违法征收房屋应支付的补偿对价。否则，将使行政机关因违法行为获利，进而产生鼓励行政机关违法征收的不利后果。
同时，作为被征收人，其对房屋被违法拆除并无任何过错，故其所获得之赔偿，不应少于同等情形之被征收人应获得之补偿。鉴于此，被征收人因违法征收而获得之赔偿，应适当高于同等情形已签约之被征收人，以达到防止行政机关借违法行为获益、保护无过错当事人的合法权益及避免对已签约被征收人不公平之法律效果。
