一般而言，宅基地使用权消灭分为绝对消灭和相对消灭。宅基地使用权绝对消灭，是指因某种客观事实或行为的出现，导致宅基地使用权人不再享有权利。因地震、河流改道、火山喷发、山体滑坡等自然灾害的原因，导致农村村民的宅基地不能恢复原状、继续使用或者灭失等情形。再比如，因某种行为的发生，导致宅基地使用权人不再享有权利。
国家为了公共利益的需要，可以依法对土地实行征收或者征用并给予补偿。土地被征收或者征用时，则会导致宅基地使用权的消灭。集体经济组织根据《土地管理法》的情形，可以依法收回土地使用权。在土地依法被收回时，宅基地使用权也不复存在。宅基地使用权相对消灭，是指因宅基地使用权主体的变化，导致宅基地使用权人丧失了权利。宅基地使用权的相对消灭，主要表现为因住宅的出卖、出租、赠与等行为而产生的宅基地使用权人的使用权消灭，从而形成新的宅基地使用权主体的情形。
有关“农村村民出卖、出租赠与住宅后，再申请宅基地的，不予批准”的规定来看，宅基地使用权消灭主要是指宅基地使用权的绝对消灭，且强调的情形是因自然灾害等原因导致宅基地灭失。宅基地使用权作为一种用益物权，其主要目的在于通过物（住宅）的效用发挥而满足他人之需。在发挥效用之物已不存在的情况下，他人基于物的效用之权利亦不应存在。对于宅基地自然灭失的情况，由于村民已失去宅基地，且符合宅基地的分配条件，有权申请分配宅基地，农村集体经济组织亦应当重新为其重新分配宅基地。
宅基地使用权的相对消灭，虽导致宅基地使用权人丧失了宅基地使用权，但该权利的丧失是当事人基于等价有偿的方式而为之，不同于宅基地的自然灭失，宅基地使用权人获得了对应的补偿，故此种情形下，宅基地使用权人无权重新申请分配宅基地。
取得宅基地使用权要不要登记？最好进行登记。宅基地使用权涉及国家对土地资源的管理，更是一种重要的用益物权。从长远发展来看，对宅基地使用权的设立、变更和消灭进行登记，既有利于加强土地管理，又有利于向社会大众公示物权的状态，从而减少争端。
《民法典》在不动产物权变动的效力上采纳的登记要件主义模式，因此，转让宅基地使用权不办理登记手续的，不发生宅基地使用权转让的法律效力，更不能对抗第三人。
