水利是国民经济的基础产业和基础设施，是国民经济和社会持续、快速、健康发展的重要保障。随着国民经济和社会事业的迅速发展，对水利事业也提出了越来越高的要求。越来越多、越来越大的洪涝灾害告诉我们必须加强建设，提高国家防洪抗灾能力，这就需要多渠道、多形式地增加投资，以尽快发展水利事业，逐步形成与社会经济发展水平相适应的综合性防洪体系。
对水利建设基金的性质、来源和使用范围作了明确具体的规定。国务院颁布的《河道管理条例》也已经明确规定开征河道工程修建维护管理费。在这些规定的基础上，将水利建设的资金来源以法律的形式加以肯定，作了两方面的规定：一是国家设立水利建设基金，用于防洪工程和水利工程的维护和建设；二是受洪水威胁的省、自治区、直辖市为加强本行政区域内防洪工程设施建设，提高防御洪水能力，按国务院的有关规定，可以规定在防洪保护区范围内征收河道工程修建维护管理费。
关于水利建设基金的设立和使用。对水利建设基金的设立和使用作了原则规定，即国家设立水利建设基金，用于防洪工程和水利工程的维护和建设，同时还规定具体办法由国务院规定。水利建设基金由中央水利建设基金和地方水利建设基金两部分组成，是用于水利建设的专项基金。中央水利基金的来源：一是从中央有关部门收取的政府性基金（收费、附加）中提取3％，应提取水利建设基金的中央政府性基金（收费、附加）项目包括：车辆购置附加费、港口建设费、铁路建设基金、市话初装费、邮电附加、中央分成的电力建设基金；二是经国务院批准的其他可用于水利建设基金的资金。
地方水利建设基金的来源：一是从地方收取的政府性基金（收费、附加）中提取3％，应提取水利建设基金的地方政府性基金（收费、附加）项目包括：养路费、公路建设基金、车辆通行费、公路运输管理费、地方交通及公安部门的驾驶员培训费、地方分成的电力建设基金、市场管理费、个体工商业管理费、征地管理费、市政设施配套费；二是有重点防洪任务的城市要从征收的城市维护建设税中划出不少于15％的资金，用于城市防洪建设；三是经省、自治区、直辖市人民政府批准征收的用于水利工程和防洪设施建设的各项基金（资金、附加、收费），统一纳入地方水利建设基金。中央水利建设基金主要用于关系国民经济和社会发展全局的大江大河重点工程的维护和建设。
地方水利建设基金主要用于城市防洪及中小河流、湖泊的治理、维护和建设。至于跨流域、跨省（自治区、直辖市）的重大水利建设工程和跨国河流、国界河流我方重点防护工程的治理费用，则由中央和地方共同负担。水利建设基金的性质属于政府性基金，纳入财政预算管理，专项列收列支。
