第一，应严格奉行我国《合同法》的一般原则。可以考虑签订过程办理公证。

第二，应做到“意思表示真实”。这就需要医患双方实事求是地对医疗行为进行认定，不妨先在协议书上各自列明观点，然后再写明双方一致认同的事实。

第三，由于纠纷争议发生后，双方多处于对峙状态。有些医院会认为达成的协议是受到患方的胁迫。其实并非如此，我国《民法通则》规定，只有在自己或自己的近亲属受到胁迫时，才属于胁迫。

第四，许多协议还规定“患者不得就此事以任何理由起诉”，是违反法律规定的做法。因为，当事人的起诉权是法律规定的权利。所以，协议的内容不能违反法律规定和公共利益。否则，将导致纠纷协议无效。如果协议签订后，医院担心患方再次起诉，不妨约定“因该医疗纠纷引起的一切债权债务关系就此终了”。

赔偿数额的确定是协议的重要内容。《条例》规定的赔偿项目及计算方法，是协商确定赔偿问题的“尺度”。我们认为，如果医患双方明确了纠纷争议构成侵权或医疗事故的，最好约定为“赔偿”，没有认定的则可用“补偿”的字眼。

最后，由于纠纷事实构成协议的主要条款，欠缺将导致合同无法实现。所以，对纠纷事实的认定最好不要省略，包括对纠纷原因、性质的认定，均应详细地写入协议。

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