首先，需要明确公司使用盗版软件，只有符合商业使用要件的，才能构成侵权。如：公司经营范围中使用该软件或者使用该软件制作成果直接或间接用于营利或企业运营。
其次，判断该员工使用盗版软件是为了个人兴趣或娱乐还是是为完成工作任务，前者不构成商业使用，后者构成商业使用。
最后，公司的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由公司承担侵权责任。但如果公司能够证明其已履行了管理义务，对员工擅自使用盗版软件的行为没有过错，不应承担责任。
我们建议：公司通过内部管理规定禁止员工使用盗版软件的行为并制订相应的惩戒措施，并且定期进行计算机软件核查，采购软件时，还应辨别同一软件的不同版本，并正确使用相应的企业版软件。
