分公司盖章劳动合同肯定是有效的，一般分公司都是经过工商部门来进行注册过的，只要有营业执照所签订的合同都是具有法律的效益，但前提劳动合同也需要由双方来进行协商而成。

如果分公司是经过工商注册的合法分支机构，公司有总公司的授权，且该劳动者就在该分公司工作，合同是有法律效力的，这样总公司也是认可的。

《中华人民共和国劳动合同法》

第十六条 劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经用人单位与劳动者在劳动合同文本上签字或者盖章生效。

劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。

第十七条 劳动合同应当具备以下条款：

(一)用人单位的名称、住所和法定代表人或者主要负责人;

(二)劳动者的姓名、住址和居民身份证或者其他有效身份证件号码;

(三)劳动合同期限;

(四)工作内容和工作地点;

(五)工作时间和休息休假;

(六)劳动报酬;

(七)社会保险;

(八)劳动保护、劳动条件和职业危害防护;

(九)法律、法规规定应当纳入劳动合同的其他事项。

劳动合同除前款规定的必备条款外，用人单位与劳动者可以约定试用期、培训、保守秘密、补充保险和福利待遇等其他事项。