福州市属公立医院：
1、福州市第一医院
2、福州市第二医院
3、福州市肺科医院
4、福州市传染病医院
5、福州市皮肤病院
6、福州市中医院
7、福州市妇幼保健院
8、福州儿童医院
9、福州市第六医院
10、福州市第七医院
11、福州市第八医院
12、福建省闽清精神病防治院
13、福州神经精神病防治医院
福州市属民营医院：
1、福州眼科医院
2、福州神康医院
3、福州福兴妇产医院
4、福州福兴妇产医院东院
5、福州东南眼科医院（金山新院）
6、福州东南眼科医院
7、福州和睦佳妇产医院
8、福州现代妇产医院
9、福州东南口腔医院
10、福州中德骨科医院
医疗机构的主管部门是福州市卫生健康委员会。
