一、概念
扰乱国家机关工作秩序罪，是指多次扰乱国家机关工作秩序，经行政处罚后仍不改正，造成严重后果的行为。本罪是刑法修正案（九）第三十一条新增加的罪名。
（一）主体
本罪主体为一般主体，凡年满l6周岁且具备刑事责任能力的自然人均能构成本罪。
（二）主观方面
本罪在主观方面只能由故意构成，过失不构成本罪。
（三）客体
本罪侵犯的客体是国家机关的正常工作秩序。
（三）客观方面
本罪的客观方面应同时满足以下三个要件：一是行为上多次。多次应当指三次或以上，偶尔的扰乱行为不构成本罪；二是受到过行政处罚。因多次扰乱行为受到过行政处罚仍不改正；三是必须造成严重后果。以上三个要件，缺一不可。至于扰乱的方式可以多种多样，可以是聚众行为，也可以是个人行为，但不管其手段行为如何，其主要目的是扰乱国家机关正常的工作秩序。
国家机关的正常工作秩序是指国家机关依法开展各项工作所需的良好的外部环境与条件。本罪的犯罪对象是各级各类国家机关。国家机关是指依法设立的具有特定国家管理职能，负责管理各项国家和社会公共事务的组织。根据其地位的不同，可以分为中央和地方国家机关；根据其性质的不同，可以分为立法、行政、司法机关和国家军事机关等等。根据宪法和有关组织法的规定，国家机关主要有全国人大及其常务委员会、县级以上人大及其常务委员会、乡人民代表大会主席团；国务院及其各部门委员会、办事机构、直属机构，县以上人民政府及其工作部门、乡人民政府、有些地方由省级或县级人民政府派出的工作机构；各级人民法院与检察院、各级军事管理机关。应当注意的是，本罪中的国家机关是指中华人民共和国的国家机关，外国驻我国的使领馆、国际组织设在我国的机构都不属于本罪犯罪对象。
本罪是结果犯，需要造成“严重后果”才能构成，何为“严重后果”，有待于法律或司法解释作出明确的规定。
二、处罚
第二百九十条　【聚众扰乱社会秩序罪】聚众扰乱社会秩序，情节严重，致使工作、生产、营业和教学、科研、医疗无法进行，造成严重损失的，对首要分子，处三年以上七年以下有期徒刑；对其他积极参加的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。
【聚众冲击国家机关罪】聚众冲击国家机关，致使国家机关工作无法进行，造成严重损失的，对首要分子，处五年以上十年以下有期徒刑；对其他积极参加的，处五年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。
【扰乱国家机关工作秩序罪】多次扰乱国家机关工作秩序，经行政处罚后仍不改正，造成严重后果的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。
【组织、资助非法聚集罪】多次组织、资助他人非法聚集，扰乱社会秩序，情节严重的，依照前款的规定处罚。
三、相关司法解释
a.中华人民共和国刑法修正案（九）
b. 最高人民法院 最高人民检察院 关于执行《中华人民共和国刑法》确定罪名的补充规定（六）
c. 最高人民法院关于《中华人民共和国刑法修正案（九）》时间效力问题的解释