履行瑕疵的合同是指合同一方未能按照合同约定履行其义务，导致合同另一方无法实现合同目的的情形。在这种情况下，可以通过以下方式弥补：

1. 请求履行

如果合同一方未履行合同义务，另一方可以向违约方请求其履行。在请求时，应当明确指出违约方未履行合同的具体内容，并给予违约方一定的合理期限履行义务。如果违约方在该期限内履行了义务，则合同可以继续履行。

2. 解除合同

如果违约方未履行合同义务，并且经过合理期限的催告后仍未履行，或者违约方的履行已经不可能或者没有必要，另一方可以解除合同。在解除合同时，应当及时通知违约方，并尽可能地减少因此而产生的损失。

3. 赔偿损失

如果违约方的未履行合同义务给另一方造成了损失，另一方可以向违约方请求赔偿。在请求赔偿时，应当提供充分的证据证明损失是由违约方的行为所导致的。如果损失可以预见，则应当按照合同约定或者法律规定的范围进行赔偿。如果损失不可预见，则应当根据公平原则进行赔偿。

总之，在履行瑕疵的合同中，应当及时采取有效措施弥补瑕疵，保护自己的合法权益。同时，也应当在合同中明确约定相应的违约责任和纠纷解决方式，以便在发生纠纷时能够及时处理。