非法经营同类营业罪与为亲友非法牟利罪在犯罪主体、犯罪客体、犯罪主观方面都带有很大的相似性，二者的共同之处均是国有公司、企业的经理、董事利用职务上的便利，将与本人任职公司相关的有利可图的业务转而自己私下经营或交给亲友经营。

刑法关于两罪的规定：
 《刑法》第一百六十五条【非法经营同类营业罪】　国有公司、企业的董事、经理利用职务便利，自己经营或者为他人经营与其所任职公司、企业同类的营业，获取非法利益，数额巨大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；数额特别巨大的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
　　《刑法》第一百六十六条【为亲友非法牟利罪】　国有公司、企业、事业单位的工作人员，利用职务便利，有下列情形之一，使国家利益遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；致使国家利益遭受特别重大损失的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金：
　　（一）将本单位的盈利业务交由自己的亲友进行经营的；
　　（二）以明显高于市场的价格向自己的亲友经营管理的单位采购商品或者以明显低于市场的价格向自己的亲友经营管理的单位销售商品的；
（三）向自己的亲友经营管理的单位采购不合格商品的。

关于立案标准：
最高检公安部《关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定》(二)
第十二条【非法经营同类营业案】国有公司、企业的董事、经理利用职务便利，自己经营或者为他人经营与其所任职公司、企业同类的营业，获取非法利益，数额在十万元以上的，应予立案追诉。
第十三条 【为亲友非法牟利案】国有公司、企业、事业单位的工作人员，利用职务便利，为亲友非法牟利，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉:
(一)造成国家直接经济损失数额在十万元以上的;
(二)使其亲友非法获利数额在二十万元以上的;
(三)造成有关单位破产，停业、停产六个月以上，或者被吊销许可证和营业执照、责令关闭、撤销、解散的;
(四)其他致使国家利益遭受重大损失的情形。

两罪的区别：
一、经营内容不同。
非法经营同类营业罪要求行为人具有具体的经营内容，该经营内容必须是与自己所在公司经营业务内容一致，如自己所在公司是销售电缆的，则无论自己私下经营或交给亲友经营，也都应当是销售电缆；
而为亲友非法牟利罪，其经营的内容既可以是相同的，也可以是不同的，不同的业务内容如“以明显高于市场的价格向自己的亲友经营管理的单位采购商品或者以明显低于市场的价格向自己的亲友经营管理的单位销售商品的”，和“向自己的亲友经营管理的单位采购不合格商品的”这两款规定就是如此。
二、是否亲自作为不同。
非法经营同类营业罪要求行为人有积极的作为，自己亲为或间接参与亲为，并具有实质性的意义；
在为亲友非法牟利罪中，不要求行为人有具体的经营作为行为，只要利用了职务上的便利，为亲友提供了帮助即可。但是，其“亲友”在客观方面必须实施一定的经营行为，付出一定的经营性劳动，这是其获取非法利益的客观基础。
三、是否实际赢利不同
非法经营同类营业罪要求行为人获取非法利益，且数额巨大的，才能构成犯罪。如果不是赢利数额巨大，依《刑法》规定，则虽然有经营同类营业的行为，却不构成犯罪。该营利数额法律规定为人民币10万元，即国有公司的董事、经理虽有同类营业行为，如赢利在10万元以下的，不以犯罪论处。
而为亲友非法牟利罪，行为人本人是否赢利在所不问，其是否构成犯罪在金钱方面另有两点：一是造成国家直接经济损失数额在十万元以上的，二是使其亲友非法获利数额在二十万元以上的。该两点中，只要具备一点，即可构成犯罪。
四、赢利的来源不同
为亲友非法牟利罪的赢利来源，来源于亲友的具体经营行为，尽管在实质上是一种利益输送的模式，但其亲友的经营行为却是实质性的，并且也可能存在一定的市场经营风险，有的可能并非一定赢利。
而非法经营同类营业罪的成立，赢利数额在10万元以上，来源于行为人本人私下亲自经营或间接经营。
五、犯罪后果不同。
为亲友非法牟利罪的成立，依《刑法》的规定，要求必须是在亲友赢利的同时，导致了国家利益遭受了重大损失为条件，如果国家利益没有遭受重大损失的，则不应构成犯罪，该损失金额为人民币10万元。但值得注意的是，该点规定与最高检公安部《关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定》(二)中的规定存在差异，依后者，为亲友非法牟利罪的成立，并不要求以给国家利益造成重大损失为条件。
六、表现方式不同。
非法经营同类营业罪多为私下偷偷摸摸地进行，带有一定的隐性性；
而为亲友非法牟利罪可以是公开的，有的以合同方式为之。

最后，依最高法现有判例观点，行为人利用职务便利，将所在公司的业务交由以其亲属名义设立的公司进行经营的，以非法经营同类营业罪定罪处罚，而不以为亲友非法牟利罪论处。