1、非法制造危险物质罪的处罚标准为：

(1)处三年以上十年以下有期徒刑；

(2)情节严重的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑；

(3)单位犯此罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照上述规定处罚。

2、法律依据：

《中华人民共和国刑法》第一百二十五条规定

非法制造、买卖、运输、邮寄、储存枪支、弹药、爆炸物的，处三年以上十年以下有期徒刑；情节严重的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。 非法制造、买卖、运输、储存毒害性、放射性、传染病病原体等物质，危害公共安全的，依照前款的规定处罚。单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照第一款的规定处罚。