总结劳动部颁布的《工资支付暂行规定》及《补充规定》的相关法律规定，以下情形为用人单位扣减工资的正当理由：
（1）用人单位代扣代缴的个人所得税；
（2）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的社会保险费用及公积金；
（3）法院裁判中要求代扣的抚养费、赡养费、扶养费；
（4）依法签订的劳动合同中有明确规定的；
（5）用人单位依法制定并经职代会批准的厂规、厂纪中有明确规定的；
（6）企业工资总额与经济效益相联系，经济效益下浮时，工资必须下浮的；
（7）因劳动者请事假等相应减发工资；
（8）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
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