分居满两年不能自动离婚，离婚只有两种方式：民政局协议离和法院诉讼离。分居满两年，协议离不成，还是得走到法院去起诉，但法官很少能根据双方分居满两年，在第一次起诉时就给判离，大多数时候都要起诉两次才能判离。

第一千零七十九条夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解;如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚:

(一)重婚或者与他人同居;

(二)实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员;

(三)有赌博、吸毒等恶习屡教不改;

(四)因感情不和分居满二年;

(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

其中分居强调的是夫妻双方互不履行夫妻义务，而不是单方面的不履行家庭义务，分居的时间必须是连续两年以上；分居的原因必须是感情破裂而分居;或者因感情破裂而分居两年，但经调解没有和好可能的。具备以上条件才能准许离婚。